近日，在北京京協(xié)和醫(yī)院學(xué)術(shù)會(huì)堂舉辦的第22期“刊媒惠”科技論文成果推介沙龍之“科技讓醫(yī)學(xué)更神奇”專場上，北京協(xié)和醫(yī)院博士黃晶晶在“下一代測序技術(shù)——讓微生物無處遁形”主題推介中，介紹了“下一代測序技術(shù)”在食源性疾病暴發(fā)中食品污染源檢測的應(yīng)用。此次活動(dòng)由中國科普研究所科學(xué)媒介中心主辦，北京科學(xué)技術(shù)期刊學(xué)會(huì)、“三四匠”工作室承辦。

　　黃晶晶介紹，2014年，17名丹麥人因感染李斯特菌死亡。當(dāng)感染患者被接連送到醫(yī)院時(shí)，臨床醫(yī)生和實(shí)驗(yàn)室研究人員在不知消費(fèi)者感染源的情況下，采用“下一代測序技術(shù)（Next generation sequencing, NGS）”對患者體內(nèi)分離出的菌株進(jìn)行序列分析，發(fā)現(xiàn)所有分離株是同一個(gè)來源，并通過與食品分離的菌株比對后發(fā)現(xiàn)，所有感染均來源于同一工廠肉質(zhì)品，為確定該事件為食源性中毒事件提供了及時(shí)、可靠的依據(jù)。這一案例顯示出基于高通量測序技術(shù)在縮短調(diào)查時(shí)間方面的優(yōu)勢。

　　據(jù)了解，食品中微生物的傳統(tǒng)檢測方法主要是培養(yǎng)法，需要依賴于微生物的分離和培養(yǎng)。然而，研究證明，目前自然界中85%—90%的微生物無法培養(yǎng)，部分可培養(yǎng)的微生物也可能處于其“生理學(xué)上可以存活但不能培養(yǎng)”的狀態(tài)，而導(dǎo)致無法被需要進(jìn)行培養(yǎng)的檢測技術(shù)檢測到。隨著測序技術(shù)的發(fā)展，不用進(jìn)行微生物培養(yǎng)、可以邊合成邊測序的新一代測序技術(shù)代表了一種更為簡單快速的微生物群落檢測方法。這些方法是在對微生物核酸序列（DNA和RNA）分析的基礎(chǔ)上發(fā)展而來，主要是通過PCR反應(yīng)（Polymerase chain reaction，聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)）對核酸序列進(jìn)行擴(kuò)增。“下一代測序技術(shù)”又稱為第二代測序技術(shù)、新一代測序技術(shù)。與代Sanger測序技術(shù)相比，NGS測序技術(shù)具有檢測通量更高、用時(shí)更少以及總體檢測費(fèi)用低等優(yōu)點(diǎn)。序列的檢測可以用于精確的鑒別微生物菌群, 包括不可培養(yǎng)的生物體和含量極少的微生物。該技術(shù)的研發(fā)，給微生物學(xué)研究帶來了巨大的變革。

　　目前，NGS已經(jīng)在一些發(fā)酵產(chǎn)品中得到了應(yīng)用，如描述某些發(fā)酵產(chǎn)品中微生物的多樣性等；還可以作為一種深度測序技術(shù)應(yīng)用在益生菌產(chǎn)品的序列分析中，部分實(shí)驗(yàn)證實(shí)其可以快速、高效地對食品中微生物結(jié)構(gòu)進(jìn)行精確分析。業(yè)內(nèi)人士認(rèn)為，由于NGS技術(shù)具有高通量、速度快以及信息全面等特點(diǎn)，其在食品微生物研究方面的應(yīng)用必將越來越成熟和廣泛，為研究者提供新的食品微生物多樣性分析的方法。

　　食品行業(yè)專家介紹，除了可以對微生物進(jìn)行快速測定外，目前NGS技術(shù)也已經(jīng)應(yīng)用于部分食品的真實(shí)性檢測，如人參、冬蟲夏草、牛排等，但對酒類、發(fā)酵類食品的真實(shí)性檢測還存在一些技術(shù)問題。

　　該場沙龍同時(shí)也就大數(shù)據(jù)、人工智能與醫(yī)療健康領(lǐng)域的科技發(fā)展進(jìn)行了分享。自2016年6月啟動(dòng)至今，“刊媒惠”推介的科技論文成果內(nèi)容涉及公眾關(guān)注的食品安全、環(huán)境保護(hù)、疾病防控、人工智能等多個(gè)領(lǐng)域，通過現(xiàn)場活動(dòng)及網(wǎng)絡(luò)直播，向線上線下公眾普及與生活息息相關(guān)的科研進(jìn)展和科技成果。