“近年來，中國(guó)學(xué)者在腸道菌群研究領(lǐng)域投稿到國(guó)際期刊上的論文數(shù)量增加很快，種種跡象都反映出中國(guó)在這個(gè)領(lǐng)域發(fā)展得非常迅速?！鄙虾＝煌ù髮W(xué)趙立平教授近日表示，腸道菌群研究領(lǐng)域在國(guó)內(nèi)外的發(fā)展都比較迅速，對(duì)在近幾年才開始進(jìn)入腸道菌群相關(guān)領(lǐng)域開展工作的年輕學(xué)者，趙立平分享了一些經(jīng)驗(yàn)。

　　“首先，所有的腸道微生物的研究都必須回答因果關(guān)系問題?！壁w立平解釋道，比如，生病的人和健康的人菌群是不一樣的，但是，是疾病令菌群變得不一樣了，還是因?yàn)榫翰灰粯幼屓说貌×?？提供相?yīng)的證據(jù)，解釋因果關(guān)系是學(xué)者研究?jī)r(jià)值的體現(xiàn)之一。學(xué)者在設(shè)計(jì)實(shí)驗(yàn)時(shí)，對(duì)所研究問題的理解不能局限在描述性的層面，不能局限在對(duì)一組病人和一組健康人做對(duì)比。

　　在數(shù)據(jù)分析方面，要注意一個(gè)新的趨勢(shì)——不再參考數(shù)據(jù)庫(kù)。趙立平表示，現(xiàn)在通過對(duì)DNA進(jìn)行大規(guī)模測(cè)序的技術(shù)，可以幫助學(xué)者獲得關(guān)于腸道菌群組成和功能的信息。但是，目前分析數(shù)據(jù)的方法有一個(gè)致命的缺點(diǎn)——缺少創(chuàng)新性。

　　趙立平解釋道，很多學(xué)者分析數(shù)據(jù)時(shí)把序列和一個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)做比較，如果和數(shù)據(jù)庫(kù)里已知的東西相似性超過一定的閾值，就給它同一個(gè)名字。這個(gè)樣品里面也有這個(gè)菌，或者也有這個(gè)基因，然后把樣品里面的這些能夠定名的基因，或者能夠定名的微生物，全部都定了名之后，再對(duì)它進(jìn)行分析。這樣一來，學(xué)者只能研究別人已經(jīng)研究過的東西，因?yàn)閿?shù)據(jù)里面肯定有一部分序列屬于從來沒有人研究過的微生物，學(xué)者拿它的DNA序列信息去和數(shù)據(jù)庫(kù)比較，那些不能和數(shù)據(jù)庫(kù)里的序列足夠像的序列，既不能給名字也不能定功能，按照現(xiàn)在的分析流程，就會(huì)被“扔掉”。

　　“雖然序列數(shù)據(jù)是完整的，但在分析時(shí)卻被分成了兩部分，一部分是和別人已經(jīng)研究過的足夠像，能給名字、定功能的序列，這些就可以繼續(xù)往下進(jìn)行分析。另外一部分，因?yàn)槭切碌臄?shù)據(jù)，別人沒研究過，所以新學(xué)者也不研究?！壁w立平表示，這樣人為地把真正有創(chuàng)新性的、可能會(huì)有新發(fā)現(xiàn)的數(shù)據(jù)丟掉，只研究和別人研究過的東西像的那部分序列，阻礙了研究的創(chuàng)新發(fā)展?！斑@其實(shí)是過去十幾年，基于DNA測(cè)序數(shù)據(jù)的微生物組研究最致命的缺陷?！壁w立平表示。

　　“所以，如果是最近才進(jìn)入這個(gè)領(lǐng)域或準(zhǔn)備進(jìn)入這個(gè)領(lǐng)域的年輕學(xué)者，建議不要走老路，不要通過參考別人的數(shù)據(jù)庫(kù)來決定分析什么或不分析什么?！壁w立平如是說。

　　此外，要把生態(tài)學(xué)的概念引入到微生物組或者腸道菌群研究里。趙立平解釋說，因?yàn)椴煌募?xì)菌，分類地位不一樣，可以合在一起來做一件事情。所以要看哪些細(xì)菌會(huì)合作形成一個(gè)功能群，影響人或者動(dòng)物的健康。找對(duì)了功能群，找到真正與健康關(guān)系比較密切的、影響比較大的那些菌，進(jìn)而對(duì)其進(jìn)行的深入研究才有意義。

　　“對(duì)于準(zhǔn)備要進(jìn)入或者剛剛進(jìn)入該領(lǐng)域時(shí)間不久的學(xué)者，建議不要參考數(shù)據(jù)庫(kù)，要從生態(tài)學(xué)的角度，把它當(dāng)成生態(tài)系統(tǒng)去研究，要看誰和誰是一個(gè)生態(tài)功能群，而不要因?yàn)樗且粋€(gè)屬，或者一個(gè)科的細(xì)菌，就把它合在一起進(jìn)行研究。腸道里面的細(xì)菌不是按照我們對(duì)它進(jìn)行的分類地位來進(jìn)行活動(dòng)的，而是按照它們之間的生態(tài)學(xué)關(guān)系進(jìn)行活動(dòng)的?！壁w立平表示。